裸燕麦高质量参考基因组发布
6月30日,由白城市农业科学院国家燕麦荞麦产业技术体系首席科学家任长忠领衔的燕麦研究团队,首次发布了六倍体栽培裸燕麦的高质量参考基因组序列,标志着我国的大粒裸燕麦研究将开启全基因组新时代。
燕麦是重要的禾谷类作物,其作为主要的多倍体作物,在生物量、活力和对环境变化的适应性方面均具有显著优势,在应对粮食安全挑战中发挥独特作用。目前,许多具有重要商业价值的作物基因组已被测序和组装,为其重要性状的遗传改良和高产优质品种选育提供了重要参考。但燕麦基因组测序工作进展缓慢,主要因为普通栽培燕麦作为六倍体基因组庞大、重复序列含量高且其中两个亚基因间有较高的同源关系导致其基因组测序组装非常困难。中国作为六倍体栽培裸燕麦的起源和主要种植中心,构建其参考基因组对我国特有的裸燕麦种质资源进行深入研究具有重要的战略意义。
由白城市农业科学院国家燕麦荞麦产业技术体系首席科学家任长忠领衔的燕麦研究团队联合四川农业大学和中科院遗传所选用目前最新的三代超长读长测序技术并辅助Hi-C染色体构象捕获技术,对来源于我国裸燕麦起源中心山西五寨的传统裸燕麦地方品种“三分三”进行全基因组测序组装,首次发布了六倍体栽培裸燕麦的高质量参考基因组序列。这不仅填补了六倍体栽培裸燕麦缺少高质量参考基因组的空白,更为多倍体物种基因组组装和进化研究提供了重要参考。
原文链接:http://agri.jl.gov.cn/xwfb/sxyw/202107/t20210702_8125270.html
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